GAM
Матеріал з ІКБГІ
(відмінності між версіями)
(→Поточна версія: 2.0) |
м (→=Див. також) |
||
| Рядок 47: | Рядок 47: | ||
* | * | ||
| − | + | ===Див. також=== | |
* [[Біоінформаційний підхід до швидкої оцінки придатності різних ділянок генома для ДНК-штрихкодування / Дуплій В.П. та ін. 2015]] | * [[Біоінформаційний підхід до швидкої оцінки придатності різних ділянок генома для ДНК-штрихкодування / Дуплій В.П. та ін. 2015]] | ||
Версія за 14:37, 24 вересня 2015
Зміст |
Get, Align, MDS - GAM
Designed & Coded: Volodymyr Duplij
Склад пакету
| Назва файлу | Тип | Призначення |
|---|---|---|
| ggam.exe | бінарний | Графічний інтерфейс користувача |
| get_seq_GB.pl | скрипт Perl | Скачування послідовностей з Генбанку |
| seq_aln.pl | скрипт Perl | Вирівнювання послідовностей |
| MDSgenera.r | скрипт R | Діаграма MDS виділення родів |
| MDSspecies.r | скрипт R | Діаграма MDS виділення видів |
| PrepMDS.pl | скрипт Perl | Підготовка даних для MDS |
| MDS-fun.r | скрипт R | Спільні функції скриптів R |
| MDSspecies.pl | скрипт Perl | Діаграма MDS з командного рядка |
