GAM
Матеріал з ІКБГІ
(відмінності між версіями)
(→Поточна версія: 2.0) |
(→Поточна версія: 2.0) |
||
| Рядок 46: | Рядок 46: | ||
[[Category: Програмне забезпечення ІКБГІ]] | [[Category: Програмне забезпечення ІКБГІ]] | ||
| + | |||
| + | [[Category:ДНК-штрихкодування]] | ||
| + | [[Category:Ідентифікація рослин]] | ||
| + | [[Category:Бази даних]] | ||
[[Category:Дуплій В.П.]] | [[Category:Дуплій В.П.]] | ||
Версія за 08:26, 11 вересня 2015
Get, Align, MDS - GAM
Designed & Coded: Volodymyr Duplij
Склад пакету
| Назва файлу | Тип | Призначення |
|---|---|---|
| ggam.exe | бінарний | Графічний інтерфейс користувача |
| get_seq_GB.pl | скрипт Perl | Скачування послідовностей з Генбанку |
| seq_aln.pl | скрипт Perl | Вирівнювання послідовностей |
| MDSgenera.r | скрипт R | Діаграма MDS виділення родів |
| MDSspecies.r | скрипт R | Діаграма MDS виділення видів |
| PrepMDS.pl | скрипт Perl | Підготовка даних для MDS |
| MDS-fun.r | скрипт R | Спільні функції скриптів R |
| MDSspecies.pl | скрипт Perl | Діаграма MDS з командного рядка |
