GAM
Матеріал з ІКБГІ
(відмінності між версіями)
(→В наших публікаціях) |
(→В наших публікаціях) |
||
| Рядок 45: | Рядок 45: | ||
===В наших публікаціях=== | ===В наших публікаціях=== | ||
| − | * Duplij V.P., Matvieieva N.A., Kuchuk M.V. Bioinformational approach for rapid assessment of different genome sites for DNA barcoding // Agrobiodiversity for improving nutrition, health and life quality – Nitra: Slovak University of Agriculutre, 2015. – P. 131-133. | + | * [[Duplij V.P.]], [[Matvieieva N.A.]], [[Kuchuk M.V.]] Bioinformational approach for rapid assessment of different genome sites for DNA barcoding // Agrobiodiversity for improving nutrition, health and life quality – Nitra: Slovak University of Agriculutre, 2015. – P. 131-133. |
===Див. також=== | ===Див. також=== | ||
Поточна версія на 15:38, 24 вересня 2015
Зміст |
[ред.] Get, Align, MDS - GAM
Designed & Coded: Volodymyr Duplij
[ред.] Склад пакету
| Назва файлу | Тип | Призначення |
|---|---|---|
| ggam.exe | бінарний | Графічний інтерфейс користувача |
| get_seq_GB.pl | скрипт Perl | Скачування послідовностей з Генбанку |
| seq_aln.pl | скрипт Perl | Вирівнювання послідовностей |
| MDSgenera.r | скрипт R | Діаграма MDS виділення родів |
| MDSspecies.r | скрипт R | Діаграма MDS виділення видів |
| PrepMDS.pl | скрипт Perl | Підготовка даних для MDS |
| MDS-fun.r | скрипт R | Спільні функції скриптів R |
| MDSspecies.pl | скрипт Perl | Діаграма MDS з командного рядка |
[ред.] Поточна версія: 2.0
[ред.] В наших публікаціях
- Duplij V.P., Matvieieva N.A., Kuchuk M.V. Bioinformational approach for rapid assessment of different genome sites for DNA barcoding // Agrobiodiversity for improving nutrition, health and life quality – Nitra: Slovak University of Agriculutre, 2015. – P. 131-133.
